對飲用水來說，若水中含有有害細菌，如傷寒、霍亂、痢疾等病菌時，便會傳播各種傳染病。當水中存在大量浮游生物（如原生動物、藻類等），會影響水的物理性質，并產生臭味和水色。若水中含有某些礦鹽雜質，也會引起各種病癥。如飲用水中含氟過多，會使牙齒產生斑紋，而引起“斑齒病”，嚴重者可使牙齒完全潰壞。至于日常生活排出的污水，也會傳播疾病。因此，研究水的處理和水質檢測分析是保證人民健康和國家建設的重要課題。

對工業用水來說，必須了解水體的物理性質和化學成分，因為各種工業用水不僅需要足夠的水量，而且因工業生產用途不同對水質也有不同的要求。例如鍋爐用水不能含有大量鈣、鎂的硫酸鹽，否則鍋爐里面將產生水垢，不但會耗費過多的燃料，而且也有可能引起鍋爐爆炸；再如，冶金工廠中的冷卻設備，對給水中懸浮物的含量有很嚴格的規定。對工業用水則考慮是否影響產品質量或易于損害容器及管道。

此外，水質檢測分析還可以為環境管理、環境科學研究提供數據和資料；確定水體中污染物的分布狀況，追溯污染物的來源、污染途徑、遷移轉化和消長規律，預測水體污染的變化趨勢；判斷水污染對環境生物和人體健康造成的影響，評價污染防治措施的實際效果；提供代表水質質量現狀的數據，供評價水體環境質量使用。